Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnnc1P19123 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tnnc1P19123 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms