Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18529 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
P18529 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18529 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18529 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18529 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18529 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
P18529 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18529 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18529 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18529 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18529 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18529 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18529 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18529 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
P18529 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18529 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18529 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18529 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18529 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18529 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18529 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
P18529 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18529 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P18529 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18529 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18529 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18529 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P18529 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18529 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18529 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18529 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P18529 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18529 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18529 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18529 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18529 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P18529 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18529 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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P18529 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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P18529 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18529 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18529 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18529 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18529 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18529 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18529 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18529 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18529 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
P18529 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18529 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18529 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18529 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18529 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18529 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P18529 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18529 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18529 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18529 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18529 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18529 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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P18529 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18529 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
P18529 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
P18529 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
P18529 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
P18529 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18529 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
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P18529 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
P18529 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
P18529 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
P18529 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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P18529 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
P18529 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
P18529 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18529 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18529 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18529 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18529 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18529 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18529 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18529 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18529 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18529 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18529 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18529 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P18529 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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