Protein–RNA interactions for Protein: P17534

Defa-rs2, Alpha-defensin-related sequence 2, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs2P17534 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa-rs2P17534 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa-rs2P17534 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa-rs2P17534 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Defa-rs2P17534 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms