Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pou4f1P17208 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms