Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tgfb3P17125 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tgfb3P17125 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms