Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ass1P16460 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ass1P16460 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ass1P16460 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ass1P16460 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ass1P16460 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ass1P16460 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ass1P16460 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ass1P16460 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ass1P16460 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ass1P16460 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ass1P16460 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ass1P16460 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ass1P16460 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ass1P16460 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ass1P16460 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ass1P16460 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ass1P16460 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ass1P16460 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ass1P16460 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ass1P16460 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ass1P16460 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ass1P16460 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ass1P16460 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ass1P16460 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ass1P16460 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ass1P16460 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ass1P16460 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ass1P16460 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ass1P16460 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ass1P16460 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ass1P16460 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ass1P16460 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ass1P16460 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ass1P16460 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ass1P16460 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ass1P16460 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ass1P16460 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ass1P16460 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ass1P16460 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ass1P16460 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ass1P16460 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ass1P16460 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ass1P16460 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ass1P16460 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ass1P16460 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ass1P16460 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ass1P16460 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms