Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd44P15379 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd44P15379 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd44P15379 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd44P15379 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cd44P15379 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd44P15379 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd44P15379 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd44P15379 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd44P15379 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms