Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 AC154616.1-201ENSMUST00000226995 804 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Chrm1P12657 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms