Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolP11369 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolP11369 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolP11369 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolP11369 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolP11369 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolP11369 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolP11369 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolP11369 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolP11369 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolP11369 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolP11369 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolP11369 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolP11369 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolP11369 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolP11369 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolP11369 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolP11369 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PolP11369 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PolP11369 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PolP11369 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PolP11369 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PolP11369 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PolP11369 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PolP11369 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PolP11369 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PolP11369 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PolP11369 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PolP11369 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PolP11369 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PolP11369 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PolP11369 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PolP11369 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PolP11369 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PolP11369 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PolP11369 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PolP11369 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PolP11369 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PolP11369 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PolP11369 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PolP11369 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PolP11369 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PolP11369 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PolP11369 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PolP11369 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolP11369 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolP11369 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolP11369 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolP11369 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolP11369 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolP11369 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolP11369 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolP11369 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolP11369 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolP11369 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolP11369 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolP11369 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PolP11369 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolP11369 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolP11369 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PolP11369 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolP11369 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolP11369 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolP11369 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolP11369 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PolP11369 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolP11369 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolP11369 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolP11369 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolP11369 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolP11369 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolP11369 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolP11369 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PolP11369 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolP11369 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolP11369 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolP11369 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolP11369 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolP11369 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PolP11369 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolP11369 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolP11369 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolP11369 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PolP11369 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PolP11369 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolP11369 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolP11369 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolP11369 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolP11369 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolP11369 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolP11369 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolP11369 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolP11369 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PolP11369 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolP11369 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PolP11369 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolP11369 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolP11369 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolP11369 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PolP11369 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms