Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnmt3cP0DOY1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dnmt3cP0DOY1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms