Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxa9P09631 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms