Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NefmP08553 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NefmP08553 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NefmP08553 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NefmP08553 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NefmP08553 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NefmP08553 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NefmP08553 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NefmP08553 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NefmP08553 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NefmP08553 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NefmP08553 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NefmP08553 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NefmP08553 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NefmP08553 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NefmP08553 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NefmP08553 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NefmP08553 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NefmP08553 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NefmP08553 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NefmP08553 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NefmP08553 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NefmP08553 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NefmP08553 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NefmP08553 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NefmP08553 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NefmP08553 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NefmP08553 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NefmP08553 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NefmP08553 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NefmP08553 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NefmP08553 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NefmP08553 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NefmP08553 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NefmP08553 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NefmP08553 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NefmP08553 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NefmP08553 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NefmP08553 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NefmP08553 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NefmP08553 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NefmP08553 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NefmP08553 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NefmP08553 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NefmP08553 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NefmP08553 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NefmP08553 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NefmP08553 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NefmP08553 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NefmP08553 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NefmP08553 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NefmP08553 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NefmP08553 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NefmP08553 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NefmP08553 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NefmP08553 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NefmP08553 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NefmP08553 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NefmP08553 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NefmP08553 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NefmP08553 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NefmP08553 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NefmP08553 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NefmP08553 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NefmP08553 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NefmP08553 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NefmP08553 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NefmP08553 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NefmP08553 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NefmP08553 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NefmP08553 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NefmP08553 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NefmP08553 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NefmP08553 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NefmP08553 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NefmP08553 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NefmP08553 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NefmP08553 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NefmP08553 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NefmP08553 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NefmP08553 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NefmP08553 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NefmP08553 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NefmP08553 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NefmP08553 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NefmP08553 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NefmP08553 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NefmP08553 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NefmP08553 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NefmP08553 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NefmP08553 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NefmP08553 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NefmP08553 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NefmP08553 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NefmP08553 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NefmP08553 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NefmP08553 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NefmP08553 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NefmP08553 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NefmP08553 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms