Protein–RNA interactions for Protein: P07744

Krt4, Keratin, type II cytoskeletal 4, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt4P07744 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt4P07744 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt4P07744 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt4P07744 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt4P07744 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt4P07744 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt4P07744 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt4P07744 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt4P07744 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt4P07744 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt4P07744 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Krt4P07744 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt4P07744 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt4P07744 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt4P07744 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt4P07744 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt4P07744 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt4P07744 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt4P07744 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt4P07744 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt4P07744 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt4P07744 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt4P07744 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt4P07744 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt4P07744 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt4P07744 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt4P07744 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt4P07744 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt4P07744 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt4P07744 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt4P07744 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt4P07744 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt4P07744 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms