Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtrP07309 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtrP07309 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtrP07309 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtrP07309 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtrP07309 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtrP07309 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtrP07309 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
TtrP07309 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtrP07309 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtrP07309 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtrP07309 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtrP07309 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtrP07309 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtrP07309 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtrP07309 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtrP07309 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtrP07309 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtrP07309 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtrP07309 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtrP07309 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtrP07309 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtrP07309 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtrP07309 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtrP07309 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtrP07309 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtrP07309 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtrP07309 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
TtrP07309 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtrP07309 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtrP07309 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtrP07309 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtrP07309 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtrP07309 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtrP07309 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtrP07309 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtrP07309 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtrP07309 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtrP07309 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtrP07309 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtrP07309 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtrP07309 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtrP07309 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtrP07309 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtrP07309 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtrP07309 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtrP07309 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtrP07309 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtrP07309 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtrP07309 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TtrP07309 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TtrP07309 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtrP07309 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtrP07309 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtrP07309 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtrP07309 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtrP07309 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtrP07309 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtrP07309 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtrP07309 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtrP07309 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtrP07309 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtrP07309 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtrP07309 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtrP07309 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtrP07309 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TtrP07309 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtrP07309 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtrP07309 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TtrP07309 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtrP07309 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtrP07309 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtrP07309 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtrP07309 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtrP07309 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtrP07309 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtrP07309 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtrP07309 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtrP07309 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtrP07309 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TtrP07309 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtrP07309 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtrP07309 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtrP07309 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtrP07309 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtrP07309 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtrP07309 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TtrP07309 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TtrP07309 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtrP07309 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TtrP07309 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtrP07309 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtrP07309 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtrP07309 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtrP07309 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
TtrP07309 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtrP07309 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtrP07309 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtrP07309 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
TtrP07309 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms