Protein–RNA interactions for Protein: P06880

Gh1, Somatotropin, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gh1P06880 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gh1P06880 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gh1P06880 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gh1P06880 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gh1P06880 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gh1P06880 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gh1P06880 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gh1P06880 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gh1P06880 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gh1P06880 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gh1P06880 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gh1P06880 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gh1P06880 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gh1P06880 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gh1P06880 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gh1P06880 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gh1P06880 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gh1P06880 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gh1P06880 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gh1P06880 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gh1P06880 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gh1P06880 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gh1P06880 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gh1P06880 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gh1P06880 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gh1P06880 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gh1P06880 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gh1P06880 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gh1P06880 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gh1P06880 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gh1P06880 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gh1P06880 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gh1P06880 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gh1P06880 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gh1P06880 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gh1P06880 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gh1P06880 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gh1P06880 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gh1P06880 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gh1P06880 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gh1P06880 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gh1P06880 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gh1P06880 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gh1P06880 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gh1P06880 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gh1P06880 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gh1P06880 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gh1P06880 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gh1P06880 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gh1P06880 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gh1P06880 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gh1P06880 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gh1P06880 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gh1P06880 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gh1P06880 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gh1P06880 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gh1P06880 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gh1P06880 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gh1P06880 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gh1P06880 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gh1P06880 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gh1P06880 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gh1P06880 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gh1P06880 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gh1P06880 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gh1P06880 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gh1P06880 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gh1P06880 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gh1P06880 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gh1P06880 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gh1P06880 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gh1P06880 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gh1P06880 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gh1P06880 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gh1P06880 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gh1P06880 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gh1P06880 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gh1P06880 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gh1P06880 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gh1P06880 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gh1P06880 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gh1P06880 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gh1P06880 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gh1P06880 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gh1P06880 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gh1P06880 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gh1P06880 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gh1P06880 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gh1P06880 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gh1P06880 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gh1P06880 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gh1P06880 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gh1P06880 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gh1P06880 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gh1P06880 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gh1P06880 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gh1P06880 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gh1P06880 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gh1P06880 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gh1P06880 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms