Protein–RNA interactions for Protein: P06797

Ctsl, Cathepsin L1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtslP06797 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtslP06797 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CtslP06797 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtslP06797 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtslP06797 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CtslP06797 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtslP06797 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtslP06797 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtslP06797 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtslP06797 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtslP06797 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtslP06797 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CtslP06797 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtslP06797 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtslP06797 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtslP06797 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtslP06797 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CtslP06797 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtslP06797 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CtslP06797 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtslP06797 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtslP06797 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtslP06797 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtslP06797 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CtslP06797 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtslP06797 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtslP06797 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtslP06797 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CtslP06797 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CtslP06797 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtslP06797 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtslP06797 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtslP06797 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtslP06797 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtslP06797 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtslP06797 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtslP06797 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtslP06797 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtslP06797 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CtslP06797 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtslP06797 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtslP06797 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtslP06797 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtslP06797 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtslP06797 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtslP06797 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CtslP06797 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtslP06797 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtslP06797 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtslP06797 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtslP06797 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtslP06797 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtslP06797 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtslP06797 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtslP06797 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtslP06797 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtslP06797 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CtslP06797 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtslP06797 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CtslP06797 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtslP06797 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtslP06797 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtslP06797 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtslP06797 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtslP06797 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtslP06797 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CtslP06797 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CtslP06797 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CtslP06797 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CtslP06797 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CtslP06797 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtslP06797 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtslP06797 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtslP06797 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtslP06797 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtslP06797 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtslP06797 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtslP06797 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtslP06797 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtslP06797 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtslP06797 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtslP06797 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CtslP06797 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtslP06797 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtslP06797 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtslP06797 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtslP06797 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtslP06797 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtslP06797 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtslP06797 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtslP06797 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CtslP06797 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtslP06797 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtslP06797 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtslP06797 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CtslP06797 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtslP06797 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtslP06797 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CtslP06797 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtslP06797 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms