Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PdgfrbP05622 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PdgfrbP05622 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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