Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04213 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04213 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04213 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04213 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04213 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04213 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
P04213 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04213 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04213 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04213 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04213 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04213 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04213 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04213 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04213 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04213 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04213 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04213 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04213 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04213 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04213 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04213 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04213 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
P04213 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04213 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04213 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04213 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04213 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04213 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04213 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04213 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04213 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04213 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04213 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04213 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04213 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04213 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04213 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P04213 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P04213 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P04213 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P04213 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P04213 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P04213 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P04213 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P04213 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P04213 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P04213 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P04213 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P04213 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P04213 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P04213 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P04213 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P04213 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P04213 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P04213 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P04213 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P04213 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P04213 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P04213 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P04213 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P04213 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P04213 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P04213 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P04213 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P04213 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
P04213 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
P04213 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
P04213 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
P04213 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P04213 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P04213 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P04213 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P04213 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P04213 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P04213 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P04213 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P04213 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P04213 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P04213 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P04213 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P04213 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P04213 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
P04213 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P04213 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P04213 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P04213 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P04213 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P04213 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P04213 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P04213 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P04213 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P04213 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P04213 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
P04213 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P04213 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P04213 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P04213 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P04213 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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