Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lamc1P02468 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lamc1P02468 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms