Protein–RNA interactions for Protein: P01942

Hba, Hemoglobin subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HbaP01942 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HbaP01942 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HbaP01942 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HbaP01942 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HbaP01942 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HbaP01942 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HbaP01942 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HbaP01942 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HbaP01942 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HbaP01942 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HbaP01942 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HbaP01942 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HbaP01942 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HbaP01942 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HbaP01942 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HbaP01942 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HbaP01942 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HbaP01942 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HbaP01942 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HbaP01942 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HbaP01942 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HbaP01942 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HbaP01942 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HbaP01942 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HbaP01942 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
HbaP01942 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HbaP01942 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HbaP01942 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HbaP01942 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HbaP01942 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HbaP01942 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HbaP01942 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HbaP01942 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HbaP01942 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HbaP01942 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HbaP01942 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HbaP01942 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HbaP01942 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HbaP01942 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HbaP01942 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HbaP01942 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
HbaP01942 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HbaP01942 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HbaP01942 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HbaP01942 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HbaP01942 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HbaP01942 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
HbaP01942 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
HbaP01942 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HbaP01942 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HbaP01942 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HbaP01942 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HbaP01942 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HbaP01942 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HbaP01942 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HbaP01942 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HbaP01942 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HbaP01942 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HbaP01942 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HbaP01942 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HbaP01942 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HbaP01942 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HbaP01942 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HbaP01942 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HbaP01942 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HbaP01942 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HbaP01942 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HbaP01942 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HbaP01942 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HbaP01942 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HbaP01942 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HbaP01942 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HbaP01942 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HbaP01942 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HbaP01942 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
HbaP01942 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HbaP01942 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HbaP01942 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
HbaP01942 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
HbaP01942 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HbaP01942 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HbaP01942 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HbaP01942 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HbaP01942 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HbaP01942 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HbaP01942 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HbaP01942 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HbaP01942 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HbaP01942 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HbaP01942 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HbaP01942 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HbaP01942 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HbaP01942 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
HbaP01942 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
HbaP01942 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HbaP01942 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HbaP01942 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HbaP01942 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HbaP01942 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
HbaP01942 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms