Protein–RNA interactions for Protein: P01665

Ig kappa chain V-III region PC 7043, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01665 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
P01665 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01665 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01665 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01665 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01665 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01665 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01665 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01665 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01665 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01665 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
P01665 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01665 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01665 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
P01665 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
P01665 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01665 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01665 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01665 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01665 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01665 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01665 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01665 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01665 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01665 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01665 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01665 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01665 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01665 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01665 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01665 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
P01665 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01665 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01665 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01665 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01665 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01665 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01665 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01665 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01665 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01665 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
P01665 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01665 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01665 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01665 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01665 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01665 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01665 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
P01665 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
P01665 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01665 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01665 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01665 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01665 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01665 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01665 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01665 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
P01665 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P01665 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P01665 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
P01665 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P01665 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
P01665 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01665 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01665 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01665 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01665 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01665 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01665 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01665 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01665 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01665 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01665 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01665 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01665 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01665 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01665 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01665 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01665 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01665 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01665 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01665 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01665 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01665 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01665 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01665 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01665 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
P01665 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01665 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01665 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01665 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01665 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01665 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01665 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01665 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01665 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01665 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01665 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01665 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
P01665 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms