Protein–RNA interactions for Protein: P01653

Ig kappa chain V-V region W3082, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01653 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01653 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01653 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01653 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01653 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01653 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01653 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01653 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01653 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01653 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01653 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01653 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01653 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01653 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01653 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01653 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01653 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01653 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01653 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01653 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01653 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01653 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01653 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01653 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01653 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01653 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01653 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01653 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01653 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01653 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01653 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01653 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01653 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01653 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01653 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01653 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01653 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01653 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01653 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01653 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01653 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01653 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01653 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01653 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01653 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01653 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01653 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01653 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01653 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
P01653 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01653 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01653 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01653 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01653 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01653 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01653 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01653 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01653 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01653 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01653 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01653 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01653 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01653 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01653 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01653 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01653 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01653 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01653 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01653 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01653 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01653 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01653 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01653 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01653 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01653 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01653 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01653 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01653 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01653 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01653 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01653 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01653 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01653 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01653 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01653 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01653 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01653 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01653 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01653 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01653 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01653 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01653 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01653 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01653 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01653 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01653 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01653 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01653 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01653 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01653 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms