Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccl20O89093 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccl20O89093 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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