Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CopeO89079 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CopeO89079 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CopeO89079 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CopeO89079 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CopeO89079 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CopeO89079 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CopeO89079 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CopeO89079 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CopeO89079 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CopeO89079 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CopeO89079 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CopeO89079 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CopeO89079 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CopeO89079 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CopeO89079 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CopeO89079 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CopeO89079 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CopeO89079 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CopeO89079 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CopeO89079 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CopeO89079 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CopeO89079 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CopeO89079 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CopeO89079 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CopeO89079 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CopeO89079 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CopeO89079 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CopeO89079 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CopeO89079 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CopeO89079 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CopeO89079 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CopeO89079 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CopeO89079 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CopeO89079 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CopeO89079 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CopeO89079 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CopeO89079 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CopeO89079 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CopeO89079 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CopeO89079 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CopeO89079 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CopeO89079 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CopeO89079 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CopeO89079 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CopeO89079 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CopeO89079 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CopeO89079 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CopeO89079 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CopeO89079 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CopeO89079 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CopeO89079 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CopeO89079 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CopeO89079 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CopeO89079 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CopeO89079 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CopeO89079 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CopeO89079 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CopeO89079 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CopeO89079 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CopeO89079 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CopeO89079 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CopeO89079 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CopeO89079 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CopeO89079 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CopeO89079 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CopeO89079 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CopeO89079 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CopeO89079 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CopeO89079 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CopeO89079 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CopeO89079 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CopeO89079 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CopeO89079 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CopeO89079 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CopeO89079 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CopeO89079 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CopeO89079 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CopeO89079 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CopeO89079 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CopeO89079 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CopeO89079 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CopeO89079 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CopeO89079 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CopeO89079 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CopeO89079 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CopeO89079 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CopeO89079 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CopeO89079 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CopeO89079 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CopeO89079 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CopeO89079 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CopeO89079 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CopeO89079 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CopeO89079 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CopeO89079 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CopeO89079 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CopeO89079 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CopeO89079 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CopeO89079 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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