Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnkO88874 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnkO88874 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnkO88874 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnkO88874 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnkO88874 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
CcnkO88874 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms