Protein–RNA interactions for Protein: O70583

Mid1, E3 ubiquitin-protein ligase Midline-1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1O70583 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mid1O70583 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid1O70583 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid1O70583 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1O70583 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1O70583 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1O70583 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1O70583 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1O70583 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms