Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Itgb5O70309 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Itgb5O70309 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms