Protein–RNA interactions for Protein: O55236

Rngtt, mRNA-capping enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RngttO55236 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RngttO55236 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RngttO55236 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RngttO55236 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RngttO55236 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RngttO55236 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RngttO55236 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RngttO55236 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RngttO55236 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RngttO55236 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RngttO55236 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RngttO55236 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RngttO55236 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RngttO55236 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RngttO55236 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RngttO55236 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RngttO55236 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RngttO55236 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RngttO55236 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RngttO55236 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RngttO55236 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RngttO55236 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RngttO55236 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RngttO55236 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RngttO55236 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RngttO55236 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RngttO55236 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RngttO55236 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RngttO55236 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RngttO55236 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RngttO55236 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RngttO55236 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RngttO55236 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RngttO55236 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RngttO55236 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RngttO55236 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RngttO55236 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RngttO55236 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RngttO55236 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RngttO55236 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RngttO55236 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RngttO55236 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RngttO55236 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RngttO55236 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RngttO55236 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RngttO55236 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RngttO55236 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RngttO55236 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RngttO55236 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RngttO55236 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RngttO55236 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RngttO55236 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RngttO55236 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RngttO55236 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RngttO55236 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RngttO55236 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RngttO55236 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RngttO55236 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RngttO55236 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RngttO55236 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RngttO55236 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RngttO55236 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RngttO55236 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RngttO55236 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RngttO55236 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RngttO55236 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RngttO55236 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RngttO55236 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RngttO55236 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RngttO55236 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RngttO55236 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RngttO55236 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RngttO55236 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RngttO55236 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RngttO55236 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RngttO55236 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RngttO55236 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RngttO55236 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RngttO55236 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RngttO55236 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RngttO55236 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RngttO55236 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RngttO55236 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RngttO55236 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RngttO55236 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RngttO55236 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RngttO55236 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RngttO55236 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RngttO55236 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RngttO55236 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RngttO55236 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RngttO55236 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RngttO55236 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RngttO55236 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RngttO55236 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RngttO55236 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RngttO55236 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RngttO55236 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RngttO55236 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RngttO55236 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms