Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ChkbO55229 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChkbO55229 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChkbO55229 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChkbO55229 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChkbO55229 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ChkbO55229 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms