Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cbx4O55187 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.1 ms