Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rpl35aO55142 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rpl35aO55142 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rpl35aO55142 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rpl35aO55142 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Rpl35aO55142 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Rpl35aO55142 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Rpl35aO55142 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
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