Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Syngr1O55100 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Syngr1O55100 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms