Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Limk2O54785 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Limk2O54785 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Limk2O54785 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limk2O54785 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Limk2O54785 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limk2O54785 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Limk2O54785 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limk2O54785 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Limk2O54785 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms