Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CrxO54751 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CrxO54751 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CrxO54751 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
CrxO54751 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CrxO54751 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CrxO54751 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
CrxO54751 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CrxO54751 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CrxO54751 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CrxO54751 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CrxO54751 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CrxO54751 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CrxO54751 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CrxO54751 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CrxO54751 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CrxO54751 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CrxO54751 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CrxO54751 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CrxO54751 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CrxO54751 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CrxO54751 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CrxO54751 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
CrxO54751 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CrxO54751 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CrxO54751 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
CrxO54751 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CrxO54751 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CrxO54751 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CrxO54751 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CrxO54751 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CrxO54751 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CrxO54751 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
CrxO54751 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
CrxO54751 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
CrxO54751 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
CrxO54751 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
CrxO54751 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
CrxO54751 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrxO54751 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrxO54751 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrxO54751 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrxO54751 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrxO54751 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrxO54751 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrxO54751 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrxO54751 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrxO54751 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrxO54751 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrxO54751 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrxO54751 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrxO54751 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrxO54751 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrxO54751 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrxO54751 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrxO54751 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrxO54751 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrxO54751 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrxO54751 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrxO54751 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrxO54751 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
CrxO54751 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrxO54751 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrxO54751 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrxO54751 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrxO54751 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrxO54751 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrxO54751 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrxO54751 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrxO54751 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrxO54751 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrxO54751 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrxO54751 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrxO54751 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrxO54751 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrxO54751 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrxO54751 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrxO54751 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrxO54751 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrxO54751 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrxO54751 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
CrxO54751 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrxO54751 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrxO54751 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrxO54751 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrxO54751 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrxO54751 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrxO54751 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrxO54751 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrxO54751 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrxO54751 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrxO54751 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrxO54751 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrxO54751 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrxO54751 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrxO54751 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
CrxO54751 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrxO54751 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
CrxO54751 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
CrxO54751 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms