Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gp1baO35930 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gp1baO35930 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms