Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pik3cdO35904 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms