Protein–RNA interactions for Protein: O35902

Dsg3, Desmoglein-3, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg3O35902 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dsg3O35902 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dsg3O35902 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Dsg3O35902 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms