Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf18O35714 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf18O35714 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms