Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ppfibp2O35711 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ppfibp2O35711 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ppfibp2O35711 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ppfibp2O35711 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfibp2O35711 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfibp2O35711 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfibp2O35711 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfibp2O35711 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfibp2O35711 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfibp2O35711 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ppfibp2O35711 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms