Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phox2bO35690 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms