Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn6O35646 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn6O35646 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn6O35646 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn6O35646 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn6O35646 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn6O35646 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms