Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk4O35493 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk4O35493 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk4O35493 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk4O35493 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk4O35493 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk4O35493 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk4O35493 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk4O35493 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk4O35493 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk4O35493 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk4O35493 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk4O35493 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk4O35493 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk4O35493 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk4O35493 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Clk4O35493 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clk4O35493 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clk4O35493 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk4O35493 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk4O35493 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk4O35493 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk4O35493 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk4O35493 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk4O35493 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk4O35493 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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