Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Prrt1O35449 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prrt1O35449 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
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