Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Xbp1O35426 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xbp1O35426 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms