Protein–RNA interactions for Protein: O35308

Slc16a8, Monocarboxylate transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc16a8O35308 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Slc16a8O35308 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms