Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad6O35182 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad6O35182 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad6O35182 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad6O35182 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad6O35182 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad6O35182 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad6O35182 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad6O35182 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smad6O35182 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad6O35182 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smad6O35182 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms