Protein–RNA interactions for Protein: O09172

Gclm, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GclmO09172 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GclmO09172 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GclmO09172 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GclmO09172 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GclmO09172 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GclmO09172 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GclmO09172 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GclmO09172 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GclmO09172 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GclmO09172 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GclmO09172 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GclmO09172 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GclmO09172 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GclmO09172 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GclmO09172 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GclmO09172 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GclmO09172 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GclmO09172 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GclmO09172 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GclmO09172 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GclmO09172 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GclmO09172 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GclmO09172 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GclmO09172 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GclmO09172 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GclmO09172 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GclmO09172 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GclmO09172 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GclmO09172 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GclmO09172 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GclmO09172 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GclmO09172 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GclmO09172 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GclmO09172 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
GclmO09172 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GclmO09172 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GclmO09172 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GclmO09172 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GclmO09172 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GclmO09172 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GclmO09172 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GclmO09172 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GclmO09172 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GclmO09172 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GclmO09172 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GclmO09172 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GclmO09172 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GclmO09172 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GclmO09172 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
GclmO09172 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GclmO09172 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
GclmO09172 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
GclmO09172 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GclmO09172 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GclmO09172 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GclmO09172 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GclmO09172 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GclmO09172 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GclmO09172 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GclmO09172 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GclmO09172 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GclmO09172 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GclmO09172 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GclmO09172 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
GclmO09172 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GclmO09172 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GclmO09172 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GclmO09172 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GclmO09172 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
GclmO09172 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GclmO09172 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GclmO09172 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GclmO09172 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
GclmO09172 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GclmO09172 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GclmO09172 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GclmO09172 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GclmO09172 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GclmO09172 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GclmO09172 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GclmO09172 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GclmO09172 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GclmO09172 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GclmO09172 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GclmO09172 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GclmO09172 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GclmO09172 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GclmO09172 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GclmO09172 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GclmO09172 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GclmO09172 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GclmO09172 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GclmO09172 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GclmO09172 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GclmO09172 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GclmO09172 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GclmO09172 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GclmO09172 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GclmO09172 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GclmO09172 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms