Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eftud2O08810 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Eftud2O08810 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms