Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp35M0QWN7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms