Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Gm3239L7N2D9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm3239L7N2D9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm3239L7N2D9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm3239L7N2D9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm3239L7N2D9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm3239L7N2D9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Gm3239L7N2D9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm3239L7N2D9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm3239L7N2D9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Gm3239L7N2D9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm3239L7N2D9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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